
2024年9月由杭州现代农业专科大学张万刚硕士生导师团体在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱海洋生物为该研究提供了亚硝基化绘制组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
繁体中文副标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202多年危害指数公式:5.7
撤稿期限:2024年9月
雇主企业单位:南京农业大学
深入分析村料:蛋白
拜谱作为新技术:亚硝基化修饰组学
技艺线路:
一、钻研导致
01.Caspase-3几丁质酶
现如今尚不了解清楚NO对caspase-3的控自制用有无归因于NO介导的S-亚硝基化,不一溶度均值的GSNO有所作为外源性NO销售,以诱骗caspase-3的身体S-亚硝基化。然而揭示,与并没有GSNO的组相对于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3化学活化酶不错大幅度降底(图1),与仍然有关资料不一。GSNO处里大幅度降底caspase-3化学活化酶的隐藏原因分析仍有待于阐发。
图1 不同于盐浓度的GSNO清理对caspase-3活力性的导致
02.Caspase-3的S-亚硝基化地步
钻研Caspase-3的亚硝基化阶段,以揭示GSNO对Caspase-3的症状性。经GSNO解决后,检则到caspase-3淀粉酶S-亚硝基化承载力增长(图2)。这个同时表面,外源性GSNO教育培养可成功失败介导caspase-3的身体外S-亚硝基化。引人诧异的是,在就没有GSNO来源于的比对组中检则到某个忽闪的S-亚硝基化带,这表面caspase-3概率情况内源性的S-亚硝基化。再者,本钻研中caspase-3的S-亚硝基化阶段较高,而caspase-3的亲水性降底,这与此前的钻研不一。同时,caspase-3的特情人S-亚硝基化突显位点尚不看不清楚,还必须要进一个步骤的思考。
图2 GSNO净化处理对caspase-3S-亚硝基化水平面的关系
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化淡化组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的编码编码序列。蓝色系符号的编码编码序列说S-亚硝基化肽,大红色符号的C说S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3生物降解结核蛋白
结淀粉酶质当作一种生活更必要的癌组织细胞骨架淀粉酶质,在恢复肌癌组织细胞空间结构特征的空间结构特征全部性和紧缩性方便起着更必要用,实验S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶质吸附的的敏主观具备更必要重要性。与Std(未用胱天淀粉酶质酶-3和GSNO孵育的原始肌黏胶纤维棉淀粉酶质)组相较于,0 μM GSNO组(肌原黏胶纤维棉和caspase-3的孵育,无GSNO)的全部结淀粉酶质含水量同质性降底,反映caspase-3对结淀粉酶质具备潜在性的的淀粉酶质水解反应力。在GSNO孵育后,全部结淀粉酶质的含水量明显的增大(P < 0.05)。不仅如此,当GSNO浓度值增高时,全部结淀粉酶质的含水量一直上涨(P < 0.05)(图5)。这些遇到反映,SNO突显的caspase-3以总体水平依赖性的玩法可抑制结淀粉酶质的吸附。
图5.S-亚硝基化caspase-3挥发结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3分解肌钙蛋清-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清调控承担责任肩部肌肉做收缩的细细的的所需肌原氯纶蛋清。TnT的挥发有特点是检验到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化环境下,caspase-3对TnT的挥发环境如同6表达,与Std组(只含caspase-3和GSNO的肌原氯纶)不同于,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写更为更为明显上升,显示caspase-3参予了TnT的挥发,不但,caspase-3与GSNO的孵育造成 30 kDa TnT越来越低。在100和200 μM GSNO组当中没得检验到更为明显的之间的关系(P > 0.05),而当GSNO的氧浓度做到400 μM 时,该细节描写更为更为明显减低(P < 0.05)。这类会发现显示了SNO淡化的caspase-3对TnT挥发的减缓角色。结蛋清和TnT是caspase-3的敏感脆弱底物,而GSNO治理 拉低了caspase-3的活力性能能造成 肌原氯纶蛋清挥发程度上拉低了。上面下面我们来分析一下,NO诱发的S-亚硝基化能能能够淡化半胱氨酸残基来调控caspase-3的活力性,借以进第一步应响到其对结蛋清和TnT的蛋清淀粉水解专业能力,于是应响到牛肉片产品品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋白质-T
二、工作小结
本研发重要途径研究方案S-亚硝基化对caspase-3突显的干扰及随后不久对羊肉肌原人造钎维身体外可降解的干扰。球淀粉酶S-亚硝基化就可以突显caspase-3的半胱氨酸残基,进而形成caspase-3灵活性降底,进几步可抑制了其对羊肉肌原人造钎维球淀粉酶的球淀粉酶蛋白质水解意识。三、拜谱总结
科学学习利用了酶活判断,亚硝基化突显组学定性分析,WB等验测的方式,发现了蛋清S-亚硝基化会突显caspase-3的半胱氨酸残基,这致使了caspase-3渗透性的降,齐头并进1步抑制性了其对牛羊肉肌原纤维棉蛋清的蛋清淀粉水解功能。本科学学习为讲解蛋清质亚硝基化对吃起来的改善机理作为没事个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球高蛋白组学、突显球高蛋白组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸编成品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total硫化呈现、游离态巯基,欢迎大家咨询!
符合学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663