代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
物质认定：消化吸收组学技术水平工艺性会对中葯中的物理物质开展详细具体分析，认定出中草药中的活力氧物质。诸如，再生利用根据质谱（MS）的消化吸收组学技术水平工艺性，会认定出冬虫夏草中的冬虫夏草皂苷等活力氧物质。本身技术水平工艺性还会划分药用价值价值和非药用价值价值组成部分的物理标上物，为中葯的性能掌控打造理论依据。
服务产品品质的把握：经过分泌组学系统，能能对草药的服务产品品质来介绍和的把握。诸如，利于花草分泌组学介绍，能能开发建设真对类类风湿性骨节炎的草药组分的服务产品品质标注的参考值方式 。不仅而且，分泌组学还能能判断草药中的渗透性组分基本渗透性缘由，如经过UPLC-Q-TOF-MS深入分析，分辩各种不同乌头花草的物理化学组分，并判断具备着镇疼特异性和亚急性渗透性的生物技术碱。
2. 中药药效机制研究
效应靶点分辨：消化吸收组学技术设备可能帮助到分辨中西药催化活性化学成分的大分子靶点。列举，分析出现雷公藤红素可经过调高Treg/TH1和Treg/Th17动平衡、传导NF-κB通道等管理机制发挥功能免疫抑制效应。
功能原则解读：消化吸收转化组学技术水平也应该阐释中药茶茶治療疫情的功能原则。随后，实验得知青蒿素耐药肺结核与疟原虫的线粒体消化吸收转化发生发生改变关于 ，非靶向疗法消化吸收转化组学阐释了与该历程涉及到的的消化吸收转化物发生改变。不仅，消化吸收转化组学还应该可以通过分享消化吸收转化物的发生改变，实验中药茶茶复方的功能原则。
3. 中药安全性评价
致癌性管理机能探讨：基础细胞代谢转化组学科技可以适用于探讨中药方的致癌性管理机能。诸如，用基础细胞代谢转化组学和16S rDNA测序的数据整合研究，揭露了清益汤对危重症发生发生急性胰腺炎有联系发生发生急性肺直接损伤的保护英文管理机能，并敲定了铁镇定自若、文化差异基础细胞代谢转化物和微生物菌群期间的联系。
平安可靠性考核：分泌组学技艺还就可以中用中西药的平安可靠性考核，鉴别不确定的致癌性物质和致癌性靶点，然后为中西药的平安可靠运行能提供科学合理措施。
4. 中医证候研究
证候有关于分泌物定量分析：分泌组学技术设备能能用来论述方法与国医证候有关于的内源性分泌物变迁，捕助国医证候的判断和预防。列如 ，使用分泌组学论述，已在冠心脏病患有中鉴定费出与痰瘀证随和阴两虚证有关于的菌物象征物。
证候调控探讨：消化吸收转化组学工艺还行广泛中用探讨西药对中医师证候的调控实际效果。列如，经由消化吸收转化组学工艺及聚类具体分析法具体分析法，出现“黄芪-茯苓-泽泻”等有关制剂配置适广泛中用肾病整合征的新组方制剂，并能对多种多样肾病整合征相关内容的生物工程标记物存在影晌。
5. 多组学技术整合应用
两组学优化：排泄组学与相关组学枝术（如DNA组学、转录组学、蛋清质组学等）的优化采用，为中成药理论研究展示 了个多基本要素的剖析框架的。这一优化采用不只加重了小编对中成药营养成分在原子体系上对人体内生理方面和疾病工作状态的会影响，况且为阐释中成药的效用措施和药用价值类物质前提展示 了强震慑力的的软件工具。
常见疾病症状缓解新管理机制：多个学系统都可以中用的研究中药方缓解常见疾病症状的原子核新管理机制。列举，使用蛋清质含量质组学和基础代谢转化组学的联手app，阐释了与中医药学等级分类的髋骨关节软骨骨性骨关节软骨炎重视相关联的差别描述蛋清质含量和基础代谢转化环路。
基础代谢组学能力在中成药探索中的app，为中成药的现如今化和深度贫困医院出具了比较重要的科学技术支持系统，有助于、引领中成药的标化和时代现代化发展前景。