
近日,长沙医科专科大学弟一复属诊所王学浩院士评选团对在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法动能代谢率检测分析服务。
国外英文标题文字:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名一级标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
买家方:南京医科大学
实验建筑材料:细胞
拜谱供给精准服务:转录组测序+蛋白酶互作组+靶点势能代谢率组
技术工艺路线地图:
深入分析但是
01、YBX1被检验为HCC中糖酵解的主要遗传基因
本研究探讨提取HCC恶性恶性良性肿癌样表(n=7)的单細胞RNA测序信息集使用介绍,找到糖酵解灵活性大部分网络化在恶性恶性良性肿癌細胞中,hdWGCNA介绍辨别出9个人类基因摸块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的繁衍介绍肯定YBX1为独立性繁衍分险要素(图1H)。进这一步构建IHC、WB研究和恶性恶性良性肿癌组识与最靠近非恶性恶性良性肿癌组识的空间转录组学信息集得知YBX1是肝細胞癌根治的隐性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被知道为改善HCC体细胞糖酵解的重要元素
02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物动能代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1构建并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1通过并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化强化其磷硝化作用,关键在于力促其核转位
进的几步测量YBX1的O-GlcNAc糖基化需不需要干扰其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC受损细胞系中或用OGT遏药物OSMI-1正确净化处理,YBX1淀粉酶平均含量取得大幅度降低,YBX1磷酸性反应取得提高(图4A-C)。IP实验操作体现 ,在一样的Flag-YBX1底物平均含量下,YBX1-WT的磷酸性反应平均含量取得过于YBX1-T57A,表示磷酸性反应的新增除了仅是因此比较高的YBX1淀粉酶表达方式爱(图4D)。拆分了核和质酚类化合物看见TMG正确净化处理的HCC受损细胞系中YBX1核表达方式爱的上升(图4E-F),进的几步看见YBX1磷酸性反应的最为关键的调系数是AKT(图4G-I)。等等看见注意O-GlcNAc糖基化凭借促使其磷酸性反应来开展YBX1淀粉酶稳定性能分析性并促使核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 修饰语语有有益于于其进一部造成磷碱化修饰语语并要能可以淡化其核转位
05、YBX1促进会PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1利于PKM2转录
06、YBX1 就可以提高了组球蛋白乳过酸修饰语水平面
设计察觉YBX1敲低相关系数大幅度减少蛋清质乳碱化,尤其要是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解控药品2-DG的实验室确认了糖酵解与组蛋清乳碱化的直观连接,控制糖酵解可相关系数大幅度减少H3K18la技术水平(图6D)。PKM2过展现不可逆转转YBX1敲低所至的H3K18la增涨,之外源乳酸整理不增加H3K18la,还引起YBX1展现调整,表示会有领域反馈系统(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la凭借生物富集于YBX1开机子直观加速其转录,该期间受O-GlcNAc糖基化监测(图6H-J),并察觉P300 调整是YBX1开展H3K18乳酰化为用的缘由(图6K-L)。
图6.YBX1明显增强H3K18乳过酸表达关卡
好文章总结
在此类学习中报到了YBX1在HCC中高体现,同时与糖酵破解切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,然而平衡球营养素并增高其体现。此类淡化还增加YBX1在T57处的磷硝化作用,增加其核易位。故此,这一种全过程增加了糖酵解一些表观遗传的转录并刺激作用乳酸的所产生。虽然,YBX1激活开通P300的转录,因此能够组球球蛋白的乳硝化作用,特点是H3K18la,H3K18乳硝化作用正方向调节YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因正反面馈环考核机制图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向药物能量消耗新陈代谢组技术服务,拜谱海洋生物建立了完善成熟的转录组学、血清组学、翻译专业后绘制组学、代谢率组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
符合文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.