草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿控制整体常用见的病之首。肾聚集中CaOx结晶过达到饱和状态磨合会出现肾小管细胞膜拉伤和凋亡，得以出现肾结石的演变成。短链碳水化合物酸由消化道内厌氧反应器病毒沤肥营养饮食玻璃纤维出现，不单单在边缘消化道防御整体中起着效用，特别在控制整体品质上也起着的关键效用。其中的，丁酸是最充沛的短链碳水化合物酸，包括抗感染和免疫抗体能够抑制效用,本的研究浅谈丁酸对CaOx肾结石的效用极其隐性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山青岛医学博士整形医院医院泌尿整形外科吴忠专家、周子健医学博士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠副教授、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网上药学学售后服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

一篇文章品牌：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 消费者标准：华山青岛博士整形医院医院 科学研究对象图片：大鼠、HK-2内部 排列信息查询：较组（Con）、模板组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提供了能力：网络数据临床药理学测量

工作思路步奏图

学习效果

探索工人首要创建大鼠实体三维模式化，按照生理学生化模式评价指标和组织开展病理报告学染色法等探索方法手段出现 丁酸也可以减掉CaOx实体三维模式化大鼠肾CaOx单晶体的造成和受伤，改进CaOx实体三维模式化大鼠的细菌感染受伤和空气防氧化物料的过度的表明。还有就是，丁酸还可抑制草酸诱导性的HK-2血血细胞受伤、空气防氧化应激反应和血血细胞凋亡。 为洞察解析一下丁酸节构和靶人类遗传dna组微信电脑网络上信息，的研究工作员从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和三维空间节构（图1A）。利用PharmMapper大数据解析源库和Uniprot大数据解析源库办理后共淘汰出11七个丁酸靶人类遗传dna组供进三步解析。将人类遗传dna组大orcale导到STRING大数据解析源库，开展PPI微信电脑网络上信息解析。Cytoscape根据了顺序排列的前20的联络线靶人类遗传dna组的详细的微信电脑网络上信息图，大部分包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。某些联络线人类遗传dna组与微信电脑网络上信息中的的人类遗传dna组均行为出特定的相关的于性，代表某些人类遗传dna组可以充分调动着协作目的。GO和KEGG解析阐明了丁酸联络线人类遗传dna组的相关的于手段和海洋分子生物学学性能（图1C）。联络线人类遗传dna组大部分与类固醇的激素类回复、被氧化的应激状态状态回复、生物学氧组织对类固醇的激素类热血的反响包括对强酸物理化学有机化合物的反响相关的。由此可见阐明，某些联络线人类遗传dna组大部分参与性了被氧化的应激状态状态和对生物学氧的海洋生物学反响进程，是肾结石型成新机制中至关更根本的手段，这发现丁酸可以在肾结石中充分调动更根本目的。

图1| 丁酸组成与靶遗传基因在线分析一下(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一次摸索丁酸对CaOx肾结石确凿切靶dna，的探索工作员利用GEO数值库对GSE73680中健康的参考与CaOx肾结石女性的dna对比完成了的探索。参考组与CaOx结石女性的不错性对比展示dna（DEGs）检测标淮为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个dna时有发生不错影向，表中3379个（89.4%）dna展示上涨，404个（10.6%）dna展示降低（图2A）。对DEGs完成聚类分析分折法分折，热图体现了前10个被选中DEGs的二维分段聚类分析分折法有特点（图2B）。接着随后，的探索工作员利用GeneCards数值库机器鉴定费了370个将会与CaOx肾结石关联的dna，排行前20位的分折dna极其关联性評分如2C已知。以便找出丁酸治疗方法CaOx肾结石的关键因素靶点，的探索工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关联dna外理得以打了个个Venn图。结果，CYP2C9被知道为丁酸影向CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。前者，的探索工作员还完成了丁酸与CYP2C9的氧分子嫁接，CYP2C9的这几个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此做用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在利用手机网络药理学学分折CYP2C9是丁酸干扰CaOx肾结石的靶基因遗传后，研究探讨工作人员还采用组织科学实验核实了CYP2C9可缩减草酸诱惑的HK-2组织的ROS总体水平、慢性炎症直接损伤和凋亡。

图2| 往往据库联办具体分析预侧CYP2C9是丁酸功能于CaOx肾结石的靶DNA

科研结果显示

本的研究第一方面会发现丁酸在休外和肚子里均能减弱CaOx肾结石三维模型的空气氧化反应应激状态状态和细菌感染受损，继而根据在线临床药学学挑选赢得丁酸影响力CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，另外根据人体细胞系实验所断定CYP2C9在草酸盐诱导型的HK-2人体细胞系ROS品质、细菌感染受损和凋亡。一些会发现表达丁酸或许根据减弱CYP2C9来减弱CaOx肾结石的空气氧化反应应激状态状态，消减细菌感染受损。某一操作过程中拜谱生物工程高技能作为了在线临床药学学高技能功能，最后拜谱生物工程高技能可加快比较成熟进一步完善的人类基因组学、蛋清质组学、细胞代谢组学等多个学厂品及高技能功能，欢迎大家详询咨询中心！ 参考价值学术论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.