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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T聚集机构就能自动判别肿癌聚集机构表面层的最首要聚集机构相匹配性复合型体(MHC)呈递的抗原而解锁天然免疫力神经元反應。MHC I类(MHC-I)原子核与CD8+ T聚集机构彼此意义,其呈递的肽最首要来原于内源性胞质球球淀粉酶的球球淀粉酶酶体光分解,而MHC II类(MHC-II)原子核最首要展示于专业性抗原提呈聚集机构,与CD4+ T聚集机构彼此意义,其呈递的肽存在可能内体前提条件光分解的胞外和胞内球球淀粉酶(图1)。由于,自动判别由MHC原子核呈递的肿癌抗原对待设定依懒T聚集机构自动判别和杀灭肿癌聚集机构的很好和安会的癌证天然免疫力神经元治疗法是至关必要的。研究背景质谱(MS)的天然免疫力神经元肽组学(Immunopeptidomics)就能从很多种聚集机构系、肿癌聚集机构和绿色健康聚集机构中高通骁龙量、立即签定MHC紧密结合肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抵抗能力生物富集MHC以及根据肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到天然免疫肽队列甚至讲述后淡化企业信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo重新测序能力,不依赖现有数据库,会高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富性的参数介绍资源为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递良性肿瘤抗原的经由

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 工作流程图

NO.2 物品基本特征

NO.3 探讨知识(个部分)

NO.4 送样提议

例案介绍

01 逻辑调查

一篇文章主题 :The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

文章发表杂物:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)不是种核效果球蛋白,在胃癌中频繁过体现,做以为淋巴肿瘤突发的驱动软件因素分析。近年来,靶向疗法XPO1的小分子式正被重复使用临床医学抗肿瘤中成药。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 一些来自XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肺部肿瘤-免疫力根治

好的文章一个题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

文章发表期刊:Nature Communications IF:16.6 2023

恶劣胸膜间皮瘤(MPM)就也是种继发性不好的侵扰性良性肿瘤。上述情况已有的治療规划由于缺乏较果,因重要要有新的治療手段。上述情况其T组织细胞浸润性,编辑统计假设MPM就也是个适宜的治療性肠癌接种疫苗的任务。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用体系结构质谱的抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶意胸膜间皮瘤免疫系统肽组学监测

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 细菌病毒mRNA接种疫苗设计

内容之类:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

撤稿报纸:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过依托于质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌染上的Hela細胞和HCT-116細胞中鉴定费MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱个人总结

免役内部肽组学是胆固醇质组学的一些高效发展前景的构成,它专业于探索免役内部系统的中由最主要聚集相溶性符合体(MHC)或人类白内部抗原(HLA)分子式呈递的免役内部肽。这种免役内部肽是内部外面呈递的肽段,够被T内部甄别,于是引起免役内部的反应。由于质谱的免役内部肽组学都已经 成技术签别MHC胆固醇呈递肽的金标准规范形式,够之间技术签别各种生活和病症感觉下各种聚集和内部性质中的免役内部肽组,如实际瘤或木马病毒感梁的内部。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫性肽组检验服务保障,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能确切且立即能提供免疫细胞系统肽编码序列,发现了多非非常典型免疫细胞系统肽,落实责任需求出可靠的新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

符合论文论文参考文献

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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