
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应表达蛋清组学产品,实现1000+深奥度淡化位点检测出,动态平衡重新精典靶点,全定位生信数据分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“出现”到“检验”全流量服务培训,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、研究标准流程
02、实测值数据显示
03、经“点”逆转
在评测数据源中,检测数个论文中通讯稿的经典之作靶点及衣康酸装饰位点,如一是个被发现的衣康酸共价装饰血清KEAP1,和糖酵解环路中的3个重要性酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体形成血清NLRP3和细胞膜挫裂方式中的重要性血清RIPK3等,其质谱图方式图如下。
04、品牌优点和缺点
1.诸多质控
商业地产化特喜欢的人查测器孵育、SDS-PAGE查测、WB验证通过、样品相关的性分析一下等各坐向查测,确定业务数据能信性。2.高质量方面质谱器材app平台
在Orbitrap Astral全第九代人高判定质谱仪提升下,建立衣康过酸淡化位点及核蛋白签别新深入,机械助力科学有效设计新发展。3.全过程一趟式服务项目
对于拜谱生物制品更加完善的检验品台,可提供了“受损细胞塑造→探头孵育→WB检验→玄妙度衣康硝化作用呈现检验→专用生信深入分析→对应位点PRM确认”全的流程的服务,省时高效呢更高效。05、探讨东西(地方)
06、运用放向
PART 2、学术论文共享
文章一
英语标题文字:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文名题头:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
探讨资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
论文二
英文版小标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
2英文主题词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
探究方面:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、例案ip产业要点
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13兼具良好的底物融入效率,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生态学衣康硝化作用淡化组测试数据信息中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用表达(相应图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
最为TCA嵌套循环中的在期间消化吸收物,衣康酸调结消化吸收、免役和细菌感染病变间的互为功用,为治愈免役细菌感染病变性消化道病提高了改用治愈措施。衣康酸的结构特征中的亲电性α,β-不是处于饱和状态羧酸的结构特征能对淀粉酶质上的活性酶半胱氨酸残基进行烷基化遮盖(迈克尔加持不良反应),这一种译成后遮盖被分为“衣康酸遮盖(itaconation)”,而能危害淀粉酶质工作,调节作用免役回话和消化吸收路经,为多种多样消化道病药剂开发提高新指导思想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸体现蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物中医药学绝对是定量分析靶向疗法分泌组(QMT1000)或养分产生靶向药物产生组货品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参阅文章
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.